背景知识
RNA结合蛋白（RNA Bindig Proteins，RBP），是具有结合双链或单链RNA能力的蛋白。RBP包含各种结构基序，例如RNA识别基序（RRM），dsRNA结合结构域（dsRBD），锌指（Zinc Finger）等。RNA结合蛋白（RBP）在RNA的转录后调控中起着核心作用，广泛参与RNA剪接，聚腺苷酸化，出核、定位以及翻译的过程，并且是mRNA稳定性的主要调控因素。
RIP-Seq（RNA immunoprecipitation and deep sequencing）是以RNA 结合蛋白免疫沉淀（RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay, RIP）为基础，采用特异性抗体对RNA结合蛋白进行免疫共沉淀。沉淀后，分离RNA，通过高通量测序，在全转录组范围内对细胞内RNA与蛋白结合情况进行分析，研究被特定蛋白特异结合的RNA区域或种类，并且可比较多个样品间差异，是研究蛋白和RNA互作最强有力的工具。
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